Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTIF3Q9H2K0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTIF3Q9H2K0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms