Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC8Q9BY41 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms