Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL3Q9BXA9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL3Q9BXA9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms