Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms