Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TXNDC17Q9BRA2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms