Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC1Q96RQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms