Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLPTM1LQ96KA5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms