Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHISA4Q96DD7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms