Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN3Q969G5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms