Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC1Q8WXC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PYDC1Q8WXC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PYDC1Q8WXC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PYDC1Q8WXC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PYDC1Q8WXC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PYDC1Q8WXC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms