Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD42Q8N9B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms