Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VPS8Q8N3P4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
VPS8Q8N3P4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms