Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4aQ8BW72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms