Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMBQ6PCB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms