Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C22orf39Q6P5X5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms