Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN11Q5T124 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN11Q5T124 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN11Q5T124 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms