Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT3Q3SXY7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms