Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VPS72Q15906 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
VPS72Q15906 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
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