Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF1Q15361 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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