Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABEP1Q15276 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms