Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BECN1Q14457 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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BECN1Q14457 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BECN1Q14457 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
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