Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms