Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 MTW1YAL034W-A 870 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 COS9YKL219W 1224 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 STL1YDR536W 1710 nt5.26□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 MRPL4YLR439W 960 nt5.26□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 OST3YOR085W 1053 nt5.26□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 NTH2YBR001C 2343 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 HOS1YPR068C 1413 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 CTS2YDR371W 1536 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YHR182WYHR182W 2358 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 GCS1YDL226C 1059 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 SCW4YGR279C 1161 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 RPS15YOL040C 429 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 RPO26YPR187W 468 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 DAL81YIR023W 2913 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 PHO8YDR481C 1701 nt5.25□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 COT1YOR316C 1320 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 UTP18YJL069C 1785 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 SHE10YGL228W 1734 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 SYG1YIL047C 2709 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 CBF1YJR060W 1056 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 TOS4YLR183C 1470 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 PDI1YCL043C 1569 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 GEP3YOR205C 1671 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 TPS3YMR261C 3165 nt5.24□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 NGL2YMR285C 1548 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 PAD1YDR538W 729 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 MND2YIR025W 1107 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YNL019CYNL019C 855 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YNL033WYNL033W 855 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 HST2YPL015C 1074 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 BBP1YPL255W 1158 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 DFG5YMR238W 1377 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 HXT5YHR096C 1779 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 MTC1YJL123C 1437 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 SMF3YLR034C 1422 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 HES1YOR237W 1305 nt5.23□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 TEF1YPR080W 1377 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 TEF2YBR118W 1377 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 UTR4YEL038W 684 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 RML2YEL050C 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 DBP8YHR169W 1296 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YPR195CYPR195C 330 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 BPL1YDL141W 2073 nt5.22□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 ECM33YBR078W 1290 nt5.21□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YAP1YML007W 1953 nt5.21□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 PAL1YDR348C 1500 nt5.21□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 RPT1YKL145W 1404 nt5.21□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ACF2YLR144C 2340 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 MRF1YGL143C 1242 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YHR127WYHR127W 732 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ARP1YHR129C 1155 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ATG17YLR423C 1254 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 UBC4YBR082C 447 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YOR1YGR281W 4434 nt5.2□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 TFC6YDR362C 2019 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 NGR1YBR212W 2019 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 EEB1YPL095C 1371 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 MCH4YOL119C 1506 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 LCP5YER127W 1074 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YGL185CYGL185C 1140 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 BNS1YGR230W 414 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 PPG1YNR032W 1107 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 BUB3YOR026W 1026 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 CKA2YOR061W 1020 nt5.19□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 GRX4YER174C 735 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 NCS6YGL211W 1080 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 CTR2YHR175W 570 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YJR085CYJR085C 318 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YNR048WYNR048W 1182 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ETR1YBR026C 1143 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 IES1YFL013C 2079 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 FOL1YNL256W 2475 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 UTP7YER082C 1665 nt5.18□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 NSI1YDR026C 1713 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ORM1YGR038W 669 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 SFK1YKL051W 1062 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 APM2YHL019C 1818 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ICE2YIL090W 1476 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 UBA2YDR390C 1911 nt5.17□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 BRF1YGR246C 1791 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 IMA1YGR287C 1770 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ADE6YGR061C 4077 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 SIT1YEL065W 1887 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 THI21YPL258C 1656 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 ENP1YBR247C 1452 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 SUA5YGL169W 1281 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YJL068CYJL068C 900 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 SWP1YMR149W 861 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 STE50YCL032W 1041 nt5.16□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 YTA6YPL074W 2265 nt5.15□□□□□ -1.58
RPN8Q08723 JAC1YGL018C 555 nt5.15□□□□□ -1.59
RPN8Q08723 RPB4YJL140W 666 nt5.15□□□□□ -1.59
RPN8Q08723 PRP45YAL032C 1140 nt5.15□□□□□ -1.59
RPN8Q08723 YHR045WYHR045W 1683 nt5.15□□□□□ -1.59
RPN8Q08723 UGA1YGR019W 1416 nt5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 107.5 ms