Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATP7AQ04656 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7AQ04656 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms