Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 UBP7YIL156W 3216 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 GIP2YER054C 1647 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YDL218WYDL218W 954 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 FYV1YDR024W 486 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 GAL83YER027C 1254 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 MEC3YLR288C 1425 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 SPS18YNL204C 903 nt5.61□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 HXT5YHR096C 1779 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 ARP10YDR106W 855 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 POR2YIL114C 846 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 JNM1YMR294W 1122 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 PGA2YNL149C 390 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 GRS1YBR121C 2004 nt5.6□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 DPH2YKL191W 1605 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 CBP1YJL209W 1965 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YNL095CYNL095C 1929 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 MAD2YJL030W 591 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 CIN4YMR138W 576 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YBL081WYBL081W 1107 nt5.59□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 SSZ1YHR064C 1617 nt5.59□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 EXO1YOR033C 2109 nt5.59□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 DXO1YDR370C 1329 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 FMP48YGR052W 1110 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 ECM1YAL059W 639 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 IMD1YAR073W 1212 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 SIS2YKR072C 1689 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 HFI1YPL254W 1467 nt5.58□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 SNM1YDR478W 597 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 PHM8YER037W 966 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 CAM1YPL048W 1248 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YPR109WYPR109W 885 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 RKM4YDR257C 1485 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 GSH2YOL049W 1476 nt5.57□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 VHS1YDR247W 1386 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 BIT2YBR270C 1638 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YER187WYER187W 426 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 LYS12YIL094C 1116 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 RPS5YJR123W 678 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 QRI5YLR204W 336 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 MLC2YPR188C 492 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YML082WYML082W 1950 nt5.56□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 HER2YMR293C 1395 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 ATE1YGL017W 1512 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 MET3YJR010W 1536 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 SEC20YDR498C 1152 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 IRC7YFR055W 1023 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 IPI1YHR085W 1005 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 DSE3YOR264W 1293 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 CAR1YPL111W 1002 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 snR32snR32 188 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 ORC5YNL261W 1440 nt5.55□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 MAD3YJL013C 1548 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 NGL2YMR285C 1548 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 PHO90YJL198W 2646 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 CTF18YMR078C 2226 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YDL129WYDL129W 876 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 NQM1YGR043C 1002 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 LEU5YHR002W 1074 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YKR104WYKR104W 921 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YPL113CYPL113C 1191 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 UBA3YPR066W 900 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 APE3YBR286W 1614 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 ATG32YIL146C 1590 nt5.54□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 DHH1YDL160C 1521 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 SLT2YHR030C 1455 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 IMG2YCR071C 441 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 GLO2YDR272W 825 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YGR011WYGR011W 327 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YKL169CYKL169C 384 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YKR041WYKR041W 753 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 NRM1YNR009W 750 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 YDR109CYDR109C 2148 nt5.53□□□□□ -1.52
YKU80Q04437 NTH2YBR001C 2343 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 SUM1YDR310C 3189 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 SKI8YGL213C 1194 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YIL028WYIL028W 399 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MRPL4YLR439W 960 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YBL044WYBL044W 369 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 CYK3YDL117W 2658 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 RSM23YGL129C 1353 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MST1YKL194C 1389 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 IXR1YKL032C 1794 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YIL067CYIL067C 2037 nt5.52□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 KCH1YJR054W 1494 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 BUD14YAR014C 2130 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MCX1YBR227C 1563 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ATO3YDR384C 828 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 CAB4YGR277C 918 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 DOT5YIL010W 648 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YBL029WYBL029W 1131 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 DFG5YMR238W 1377 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PWP1YLR196W 1731 nt5.51□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ACS2YLR153C 2052 nt5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms