Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ERCC6Q03468 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERCC6Q03468 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ERCC6Q03468 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms