Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF9Q00978 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF9Q00978 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms