Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1BQ00975 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms