Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK3Q00526 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK3Q00526 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK3Q00526 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms