Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMF1P82094 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TMF1P82094 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TMF1P82094 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TMF1P82094 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TMF1P82094 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TMF1P82094 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TMF1P82094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TMF1P82094 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMF1P82094 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TMF1P82094 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMF1P82094 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TMF1P82094 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TMF1P82094 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TMF1P82094 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TMF1P82094 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TMF1P82094 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TMF1P82094 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TMF1P82094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TMF1P82094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TMF1P82094 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TMF1P82094 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TMF1P82094 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMF1P82094 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TMF1P82094 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TMF1P82094 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TMF1P82094 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TMF1P82094 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TMF1P82094 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TMF1P82094 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
TMF1P82094 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TMF1P82094 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TMF1P82094 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TMF1P82094 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TMF1P82094 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TMF1P82094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TMF1P82094 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TMF1P82094 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms