Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBX1P62877 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBX1P62877 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBX1P62877 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBX1P62877 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBX1P62877 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBX1P62877 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBX1P62877 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBX1P62877 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms