Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMUP48645 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMUP48645 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMUP48645 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMUP48645 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NMUP48645 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMUP48645 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMUP48645 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMUP48645 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMUP48645 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMUP48645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMUP48645 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMUP48645 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMUP48645 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMUP48645 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms