Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFX2P48378 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFX2P48378 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFX2P48378 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFX2P48378 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFX2P48378 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFX2P48378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFX2P48378 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFX2P48378 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFX2P48378 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFX2P48378 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFX2P48378 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFX2P48378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RFX2P48378 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFX2P48378 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFX2P48378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFX2P48378 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFX2P48378 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFX2P48378 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms