Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms