Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E2P29084 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E2P29084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E2P29084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E2P29084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E2P29084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E2P29084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E2P29084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E2P29084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E2P29084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E2P29084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E2P29084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E2P29084 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E2P29084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E2P29084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E2P29084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms