Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
KIAA0556O60303 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIAA0556O60303 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIAA0556O60303 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms