Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms