Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIFINA4D1Z8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIFINA4D1Z8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIFINA4D1Z8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms