Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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