Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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