Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms