Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms