Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms