Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms