Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPJQ9HC77 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms