Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A8Q9C0K1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms