Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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