Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA6-209ENST00000514100 1682 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 LPXN-202ENST00000528489 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 IAPP-201ENST00000240652 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087203.3-201ENST00000602981 1547 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 GPHA2-201ENST00000279168 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 COPS5P1-201ENST00000415778 785 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-233ENST00000442326 668 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 PPBPP2-202ENST00000514391 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022778.1-201ENST00000518302 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 GLYATL1P3-201ENST00000527482 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG2-228ENST00000530800 566 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 BEX5-203ENST00000543160 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023034.2-201ENST00000559428 476 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN16-205ENST00000592955 927 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093503.2-201ENST00000597609 296 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021878.2-201ENST00000602718 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms