Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF1Q8N6C5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms