Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms